Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MPP1Q00013 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms