Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAP25P60880 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAP25P60880 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms