Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB38P57729 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms