Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms