Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRXP46100 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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