Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A3P43003 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A3P43003 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A3P43003 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms