Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms