Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTX2P32243 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms