Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms