Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms