Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2AP28223 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2AP28223 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2AP28223 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms