Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms