Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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