Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NF1P21359 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NF1P21359 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NF1P21359 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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