Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOLR1P15328 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOLR1P15328 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms