Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTPCP11686 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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