Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF3P11487 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGF3P11487 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGF3P11487 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms