Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms