Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APODP05090 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APODP05090 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms