Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms