Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms