Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNMO15061 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNMO15061 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNMO15061 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms