Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
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