Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms