Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms