Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIAS3Q9Y6X2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms