Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms