Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms