Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms