Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDRG4Q9ULP0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms