Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms