Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms