Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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