Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms