Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP35Q9NRY4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms