Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms