Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM15Q9C019 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms