Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms