Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms