Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNPPD1Q9BV87 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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