Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TXNDC17Q9BRA2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms