Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3AQ96ST3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms