Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms