Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms