Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD2Q96C19 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms