Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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RABGGTAQ92696 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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