Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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COPS9Q8WXC6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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COPS9Q8WXC6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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