Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HELQQ8TDG4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms