Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC112Q8NEF3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms