Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms